Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ell2Q3UKU1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms