Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LchnQ3UHG7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms