Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trafd1Q3UDK1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms