Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms