Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms