Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LcorlQ3U285 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms