Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms