Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms