Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms