Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms