Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms