Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc10Q3TLI0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms