Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca4Q3TKT4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms