Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp39Q3TIX9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp39Q3TIX9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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