Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms