Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms