Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm1123Q1RME4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms