Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300lgQ1ERP8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms