Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ptchd1Q14B62 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ptchd1Q14B62 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ptchd1Q14B62 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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