Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpusd2Q149F1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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