Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms