Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli2Q0VGT2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms