Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne7Q0VE82 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms