Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Itgb8Q0VBD0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms