Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab42Q0PD08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms