Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms