Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms