Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssrp1Q08943 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms