Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc4Q08624 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxc4Q08624 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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