Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms