Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms