Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms