Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bp2Q06649 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms