Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Thbs3Q05895 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Thbs3Q05895 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Thbs3Q05895 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Thbs3Q05895 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Thbs3Q05895 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms