Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmn1Q05860 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms