Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms