Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms