Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl7Q03366 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms