Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fgfr4Q03142 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms