Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms