Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms