Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb4Q02738 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms