Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GscQ02591 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GscQ02591 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GscQ02591 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GscQ02591 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GscQ02591 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GscQ02591 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GscQ02591 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GscQ02591 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GscQ02591 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms