Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcd1Q02242 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms