Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcqQ02111 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms