Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snai1Q02085 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms