Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms