Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms