Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Top2aQ01320 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms