Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EgfrQ01279 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms